Asmussens theologische, kirchenpolitische wie politische Entwicklung führte ihn immer wieder zwischen alle Fronten. In enger Zusammenarbeit mit Karl Barth verantwortete er die Barmer Theologische Erklärung vom Mai 1934, schuf damit die theologische Basis für die Bekennende Kirche, brachte sich aber in bleibenden Gegensatz zum etablierten Luthertum. Er gehörte zu den Wegbereitern der Stuttgarter Schulderklärung vom Oktober 1945. Die politische Theologie Barths und die positive Einstellung seiner engsten Weggefährten (Martin Niemöller) zum Marxismus trennten Asmussen schließlich auch von diesen. Seit Ende der 1930er Jahre führten ihn Fragen um Kirche, Amt und Ordination zur Aufnahme katholischer Gedanken und zu einer Förderung der Ökumene mit dem römischen Katholizismus – eine Orientierung, die ihn im Protestantismus generell belastete. Die Genfer Ökumene lehnte er entschieden ab. In seiner eigenen Kirche isoliert, setzte sich Asmussen uneingeschränkt für die Politik Konrad Adenauers ein, ohne in evangelischen Kreisen noch größeren Einfluss zu haben. Als theologischer Lehrer und Interpret (kirchlicher) Zeitgeschichte veröffentlichte Asmussen weit über 80 Bücher und Aufsätze.